Ну про 3 года вы возможно погорячились, сейчас гражданство Эквадора по браку , получают в течении месяца. С принятием новой конституции все нормы поменялись, посему рекомедую проконсультироваться в регистро цевиль
Седула - документ только внутреннего пользования, посему билеты в любом случае на паспорт.В вашем случае - на Российский.
Думаю со статусом у KSU проблем быть не должно, она въезжала как жена эквадорца, о чём у неё в паспорте должна стоять соответствующая виза. А вот если она получит гражданство, то таки да, надо будет сходить и изменить статус в миграсьоен - у них с истранхерией судя по проблемам у Osha - связь напрочь отсутствует